主角鹿目圆与好友美树沙耶香、学姐巴麻美以及来佐仓杏子等人，每晚都跟「梦魇」作战。某一天，晓美焰转学进入见泷原国中，加入小圆等人，变成五名魔法少女，加上蓓蓓以及丘比，合称「魔法少女神圣五重奏（PuellaMagiHolyQuintet）」。