《碧蓝幻想》的故事发生在一个大陆飘浮在天空的世界。多年前，世上曾发生名为“星之民”与“空之民”的战争，战事最终以空之民打倒了拥有神秘技术的星之民而告终。而游戏的主角则是生活在某个浮空岛上的少年，他生活的村落在军事帝国战舰失事中遭到摧毁