以由名为Sphere的系统管理日常生活的世界为舞台，讲述主人公们与威胁着系统的Siglos战斗的故事。主人公和泉朔也本来是一名普通的高中生，因为经常上课迟到而被同学一之宫琴音说教。由于父母双亡，他从上高中起，就和义妹和泉灯花过着同居生活。