少年穆欧鲁因杀害上级的冤罪而遭到逮捕，被送往杳无人烟的共同灵园。在等待逃走机会的某天夜晚，穆欧鲁邂逅了自称守墓者的美少女梅丽亚──埋葬人类天敌「黑闇（TheDARK）」的墓地中，少年遇见了少女，故事就此展开。